以深耕积淀力量，以专业迸发锋芒。

鲲羽生物聚焦单细胞空间组与基因原位检测技术的开发与应用，陪伴广大科研工作者潜心钻研、聚力攻坚，深耕沉淀、蓄力迸发。2026年上半年，我们以特色技术与产品助力客户发表多项优质学术成果，累计影响因子达166.8，覆盖神经科学、肿瘤学、病原免疫等多个领域。这些成果中，影响因子10分以上的占比53.8%，其中Q1区期刊文章占比100%。

客户文章与技术应用一览表

在此，让我们恭喜以上研究成果的同时为各位科研工作者分享几篇代表性案例，提供一些研究前沿成果与技术应用案例。

代表文章案例分享

Ø CRISPR 激活筛选实验发现 SPART 是广谱正黄病毒的抑制因子

文章标题：A CRISPR activation screen identifies SPART as a pan-orthoflavivirus restriction factor（IF:18.7）

研究团队：华中农业大学曹胜波老师团队，2026.03

期刊：Cell Host & Microbe

技术场景：病原-宿主互作（π-FISHRainbow试剂盒）

研究成果：

黄病毒属病毒（寨卡、登革、乙脑、西尼罗等）经蚊传播，可致成人神经疾病与胎儿先天畸形，无获批抗病毒药物。这类病毒一般进入细胞后经内吞、融合、脱壳释放基因组 RNA 完成复制，宿主蛋白可促进或限制感染。现有研究多聚焦病毒依赖因子，广谱限制因子仍待挖掘。研究团队以 CRISPR 激活筛选寻找寨卡病毒限制因子，为黄病毒通用靶点与宿主靶向疗法提供依据。

图1 π-FISHRainbow试剂盒实现病毒基因组RNA（vRNA）的亚细胞定位

研究利用π-FISH Rainbow试剂盒原位示踪病毒基因组 RNA（vRNA）的亚细胞定位，揭示ZIKV、DENV基因组RNA在感染早期的脱壳与基因组释放过程，证实SPART阻断病毒在脱壳阶段，而非吸附、内吞或翻译环节；并对比 SPART 过表达、ITCH 敲除、Baf‑A1 处理等条件下vRNA 的分布差异，锚定分子机制—SPART/ITCH 调控通路让 vRNA 被“锁”在内体，无法进入细胞质启动复制，同时验证 C 蛋白关键位点突变（ZIKV‑K5R、DENV‑K6R）对 vRNA 释放的影响。

Ø 人类大脑皮层中的纺锤神经元具有独特的放电特征与转录组特征

文章标题：Spindle neurons in human cortex possess distinctive firing properties and transcriptomic signatures（IF:16.6）

研究团队：复旦大学脑科学转化研究院与华山医院舒友生老师团队，2026.04

期刊：Nature Communications

技术场景：单细胞测序+靶向空转绘制空间分子特征（MiP-seq技术服务，π-FISHRainbow试剂盒）

研究成果：

纺锤神经元（SPNs/VENs）是人类、类人猿等大脑特有的特殊神经元，集中于前扣带回、脑岛等皮层，与高级认知、社会功能相关，其异常与自闭症、额颞叶痴呆等脑病密切相关。此前仅明确其独特形态，受人类脑组织获取限制，它是否具备专属电生理特性与转录组特征、是否为独立神经元亚型，一直缺乏系统验证，现有分子标记也无法精准区分它与邻近锥体细胞，核心科学问题悬而未决。

图2 MiP-seq实现特定细胞类型的特定基因空间表达特征绘制

研究团队基于前期探索结合MiP-seq（靶向空间组）检测已知 SPN 标记基因ADRA1A、SULF2、MEIS2的表达位置与强度，验证了人类脑皮层中纺锤神经元（SPNs）的分子身份，确保记录细胞是真实 SPN。同时利用π-FISH试剂盒以SLC17A7表达标记谷氨酸能神经元勾勒胞体轮廓，区分 SPNs 与邻近锥体细胞（PCs），确认这些标记基因同时高表达于 SPNs 与 ET‑PCs，证明常用 SPN 标记并非特异，而是ET‑PC 谱系共性标记，为后续转录组区分提供依据；并为单细胞电生理与 patch‑seq 结果提供原位验证，提升细胞分型可信度。

Ø 基底样恶性细胞RUNX3+：膀胱癌中免疫抑制微环境的“构建者”——基于单细胞和空间转录组学的全面生物信息学分析

文章标题：RUNX3⁺ basal-like malignant cells: architects of an immunosuppressive microenvironment in bladder cancer: a comprehensive bioinformatics analysis of single-cell and spatial transcriptomics（IF:10.3）

研究团队：湖北肿瘤医院刘三河老师团队，2026.05

期刊：International Journal of SURGERY

技术场景：单细胞测序+靶向空转绘制肿瘤微环境（MiP-seq技术服务）

研究成果：

膀胱癌复发率高、进展快，现有免疫治疗因耐药与免疫逃逸而效果受限，亟需精准分子分型及预后标志物指导个体化治疗。传统bulk转录组的分子分型无法揭示肿瘤内部高度异质性及微环境互作，对免疫抑制机制解析不足。目前，基底样恶性细胞的调控因子、免疫抑制微环境的构建机制与预后价值尚未系统阐明，这成为本研究的关键切入点。

研究首先整合了5个公共单细胞数据集（62个样本，超53万个细胞），鉴定出9种主要细胞类型，聚焦于发现的高表达RUNX3的基底样恶性上皮细胞亚群（C8）。该亚群通过MIF–CD74信号轴招募耗竭性CD8⁺ T细胞、IL7R⁺幼稚T细胞和FCN1⁺单核细胞，同时激活PI3K–AKT–mTOR通路，从而塑造免疫抑制微环境；预后分析也证实RUNX3高表达与膀胱癌患者不良生存显著相关。

图3 MiP-seq（靶向空间组）助力肿瘤微环境的绘制

后续利用MiP-seq（靶向空间组）对4个膀胱癌样本的组织区域（肿瘤核心区、交界区、基质区）进行精准划分，并验证了PI3K-AKT-mTOR与MIF-CD74这两条关键信号通路的活性在组织空间中呈现出从肿瘤核心区向周边基质区递减的特征，证实了其活化主要局限于肿瘤区域内；同时直观证实了RUNX3⁺基底样恶性细胞与单细胞分析发现的三类免疫细胞在空间位置上高度共定位，在肿瘤组织中形成“巢状结构”，即恶性细胞在癌巢中围绕着免疫细胞，形成免疫抑制微环境。系统阐明了RUNX3⁺基底样恶性细胞是构筑膀胱癌免疫抑制微环境的关键核心，并为膀胱癌的精准分子分型与潜在靶点发现提供了新的重要线索。

Ø HiChew 技术实现单细胞水平下经富集后高效染色质构象捕获

文章标题：Highly efficient chromatin conformation capture with post-enrichment in single cells by HiChew（IF:9.4）

研究团队：华大基因唐冲老师团队，2026.04

期刊：Genome Biol.

技术场景：亚细胞分辨率特殊RNA类型空间定位（MiP-seq技术服务）

研究成果：

染色质构象捕获技术是解析基因组三维结构的核心工具，传统 Hi-C 依赖生物素富集，单细胞版本存在 DNA 损失、连接效率低问题；无富集策略如 Dip-C 虽提升连接效率，但需全基因组测序，数据浪费超 90%，有效对比例仅 8%-15%，测序成本高、稀有构象检测受限。现有单细胞 3C 方法难以兼顾效率、灵敏度与低成本，亟需一种能简化流程、减少 DNA 损失、提升有效数据利用率的新技术，以满足低起始量与单细胞水平的高精度三维基因组研究需求。

图4 MiP-seq（靶向空间组）解析特定基因片段在亚细胞分辨率下的空间定位

研究团队针对以上需求开发出了一种新型高效染色质构象捕获方法HiChew，该方法结合了高效的黏性末端连接技术与基于PCR后甲基化的富集技术，可以处理大规模细胞数量以及对每个细胞进行超深度测序，更有效地检测染色质构象。其中，研究者利用MiP-seq（靶向空间组）针对HEK293T 细胞中 B compartment 的长基因 CNTNAP2 Intron区域进行定位，直接观测该基因转录位点在细胞核内的空间位置，重点测量其与核膜/核纤层的距离。用成像证据支持Chrom3D 建模理论：转录活跃（melting 状态）的染色质更远离核膜，而转录沉默（concretion 状态）更靠近核膜；证明 B compartment 基因激活伴随脱离核纤层，为 “TAD melting 促进转录” 提供直接空间定位证据。

多年深耕，半载硕果；初心不改，步履不停。每一篇文章成果的背后都是客户团队在设计实验、采集数据、反复验证中的努力与付出。再次恭喜以上客户取得的科研成果，也感谢客户对我们的信赖与认可，鲲羽生物将持续深耕技术、优化产品，为广大客户提供更优质的生命科学研究工具与解决方案，助力科学探索与临床转化，以自主核心技术创新树立民族品牌。