鲲羽生物科技有限公司联合创始人曹罡教授,林达博士,以及徐伟泽博士于2022年10月4日在国际知名期刊Nature Communications上发表论文,利用单细胞染色质构象捕获技术sciDLO Hi-C(图1),系统解析了单核巨噬细胞在分化与免疫活化过程中染色质空间构象重塑。这是继2018年Nature Genetics,2021年Science Advances之后,曹罡教授第三次在国际知名期刊上发表空间基因组学系列研究成果。一系列先进技术的发表标志着鲲羽生物技术团队在空间基因组技术研发领域进入国际第一方阵。
图1:sciDLO Hi-C实验流程图(Nature Communications, 2022)
sciDLO Hi-C以曹罡教授与林达博士前期发表在Nature Genetics(IF = 41.3)上的DLO Hi-C技术(图2)为基础,引入了“条形码DNA接头”和“拆分池”技术。在文库构建过程中,将组织单细胞悬液通过多轮的混合与拆分,使每个细胞带上独有的标签,然后通过混合测序,同时捕获群体细胞与群体中单个细胞的染色质空间构象信息。
图2:DLO Hi-C实验流程图(Nature Genetics, 2018)
利用sciDLO Hi-C,一次实验可以捕获高达1000余个单细胞染色质空间互作信息,对发育生物学、肿瘤进化、以及神经生物学领域有巨大的推动作用。Nature Genetics专门发表评论文章,对我们的工作给予高度评价(图3)。鲲羽生物技术团队运用具有自主知识产权的空间组学技术发现了病毒基因组与宿主基因组跨界互作的空间基因组构象,揭示了病原逃逸先天免疫系统清除机理,发掘了抗病毒及抗结核药物设计新靶点。
图3:Nature Genetics专题评论文章(Stadhouders, Ralph. "Expanding the toolbox for 3D genomics." Nature Genetics 50.5 (2018): 634-635.)
相关论文链接:
https://www.nature.com/articles/s41588-018-0111-2